发现与人类惊人相似的斑马鱼基因组

根据《自然》杂志上发表的一篇论文，编码蛋白质的人类基因中有70%与斑马鱼(Danio rerio)中的基因有关，而已知与人类疾病有关的基因中有84%与斑马鱼相对应。

该小组开发了高质量的带注释的斑马鱼基因组序列，以与人类参考基因组进行比较。只有两个其他大型基因组已被测序到这一高标准：人类基因组和小鼠基因组。完整的斑马鱼基因组将是推动人们基因功能和疾病研究的重要资源。

斑马鱼在生物学上与人非常相似，并且与人类拥有大多数相同的基因，这使它们成为了解基因如何在健康和疾病中起作用的重要模型。

“与所有生物医学研究一样，我们对该项目的目标是改善人类健康。该基因组将使研究人员能够了解我们的基因如何工作，以及遗传变异如何以人类或其他生物无法轻易研究的方式引起疾病。”研究的资深作者，惠康信托基金会桑格研究所的Derek Stemple博士说。

斑马鱼的研究已经导致癌症和心脏病研究的生物学进步，并且正在增进我们对肌肉和器官发育的理解。斑马鱼已被用于验证肌营养不良症的病因基因，也用于了解黑色素瘤或皮肤癌的演变和形成。

“绝大多数人类基因在斑马鱼中都有对应的基因，特别是与人类疾病有关的基因。这种高质量的基因组证明了许多从事该项目的科学家的努力，并将在未来几年内刺激生物学研究。通过在斑马鱼中对这些人类疾病基因进行建模，我们希望世界范围内的资源能够提供有关这些基因功能的重要生物学信息，并可能找到药物开发的新靶标。”同样是维康信托基金会桑格研究所的资深作者Jane Rogers教授解释说。

斑马鱼基因组具有一些独特的特征，这是其他脊椎动物所没有的。迄今为止，它们在任何脊椎动物物种中的基因组序列中都具有最高的重复含量：几乎是其最接近的亲鱼鲤鱼的两倍。该团队还发现了影响性别决定的染色体区域，这对斑马鱼也很独特。

斑马鱼的基因组与人类基因组相比，几乎没有假基因-被认为是通过进化失去了功能的基因。

该团队在斑马鱼基因组中鉴定出154个假基因，仅占人类基因组中大约13,000个假基因的一小部分。

“要认识到斑马鱼可以为人类健康带来的好处，我们需要全面了解基因组-与人类基因组的相似性和差异。有了斑马鱼基因组，我们现在可以更好地了解我们的基因组变化如何导致疾病。”马克斯·普朗克发展生物学研究所合著者，诺贝尔奖获得者克里斯蒂安妮·努斯莱因-沃尔哈德教授说。

Stemple博士说：“该基因组将有助于发现导致常见和罕见疾病的生物学过程，并为疾病筛查和药物开发开辟令人振奋的新途径。”

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